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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
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Fecha : |
17/04/2017 |
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Actualizado : |
11/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
LAKIN, S.M.; DEAN, C.; NOYES, N.R.; DETTENWANGER, A.; ROSS, A. S.; DOSTER, E.; ROVIRA, P.J.; ABDO, Z.; JONES, K.L.; RUIZ, J.; BELK, K.E.; MORLEY, P.S.; BOUCHER, C. |
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Afiliación : |
STEVEN M. LAKIN; CHRIS DEAN; NOELLE R. NOYES; ADAM DETTENWANGER; ANNE SPENCER ROSS; ENRIQUE DOSTER; PABLO JUAN ROVIRA SANZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. Department of Animal Sciences, Colorado State University, USA.; ZAID ABDO; KENNETH L. JONES; JAIME RUIZ; KEITH E. BELK; PAUL S. MORLEY; CHRISTINA BOUCHER. |
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Título : |
MEGARes: an antimicrobial resistance database for high throughput sequencing. |
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Fecha de publicación : |
2017 |
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Fuente / Imprenta : |
Nucleic Acids Research, 2017 v.45 p.574-580. |
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DOI : |
10.1093/nar/gkw1009 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article History: Published online 2016 Nov 24.
DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkw1009 |
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Contenido : |
Antimicrobial resistance has become an imminent concern for public health. As methods for detection and characterization of antimicrobial resistance move from targeted culture and polymerase chain reaction to high throughput metagenomics, appropriate resources for the analysis of large-scale data are required. Currently, antimicrobial resistance databases are tailored to smaller-scale, functional profiling of genes using highly descriptive annotations. Such characteristics do not facilitate the analysis of large-scale, ecological sequence datasets such as those produced with the use of metagenomics for surveillance. In order to overcome these limitations, we present MEGARes (https://megares.meglab.org), a hand-curated antimicrobial resistance database and annotation structure that provides a foundation for the development of high throughput acyclical classifiers and hierarchical statistical analysis of big data. MEGARes can be browsed as a stand-alone resource through the website or can be easily integrated into sequence analysis pipelines through download. Also via the website, we provide documentation for AmrPlusPlus, a user-friendly Galaxy pipeline for the analysis of high throughput sequencing data that is pre-packaged for use with the MEGARes database. |
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Palabras claves : |
BASE DE DATOS; BIOINFORMÁTICA; DATASETS; DRUG RESISTANCE; GENES; METAGENÓMICA; METAGENOMICS; MICROBIAL; POLYMERASE CHAIN REACTION; PUBLIC HEALTH MEDICINE; RESISTENCIA ANTIMICROBIANA; SEQUENCE ANALYSIS. |
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Asunto categoría : |
L01 Ganadería |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6677/1/Rovira-arb-2017-1.pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210519/
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Marc : |
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Registro original : |
INIA Treinta y Tres (TT) |
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Biblioteca
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Identificación
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Origen
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Cutter
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Registro
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Volumen
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Estado
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| Registros recuperados : 312 | |
| 84. |  | DURAN, H.; ALLES, G.; LA MANNA, A.; RAVAGNOLO, O.; LOPEZ-VILLALOBOS, N. Modelo de simulación de tambos : 1. Consumo de pasturas y suplementos. In: CONGRESO ARGENTINO DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 32. 2009. Resúmenes. Malargüe, Mendoza, AR: AAPA, 2009. (Revista Argentina de Producción Animal, v. 29, supl.1, p. 376-377, 2009).| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 85. | | DURAN, H.; ALLES, G.; LA MANNA, A.; RAVAGNOLO, O.; LOPEZ-VILLALOBOS, N. Modelo de simulación de tambos: 2. Partición de la energía en la vaca. In: CONGRESO ARGENTINO DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 32. 2009. Resúmenes. Malargüe, Mendoza, AR: AAPA, 2009. Revista Argentina de Producción Animal, v. 29, supl.1, p. 377-378, 2009.| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 89. | | DURAN, H.; LA MANNA, A.; ACOSTA, Y.; MIERES, J. Propuestas validadas de INIA sobre alternativas para incrementar la producción de leche y/o sólidos por hectárea en forma rentable. Agrociencia Uruguay, v. 14, no.3, p. 96-100, 2010. Agrociencia, Nro especial: Congreso Asociación Uruguaya de Producción Animal, 3., 4-5 Noviembre 2010, Montevideo, UY: INIA, Facultad de Agronomía, SMVU.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Nacionales | Circulación / Nivel : B - 5 |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 90. | | DURAN, H.; LÓPEZ-VILLALOBOS, N.; ALLES, G.; LA MANNA, A.; RAVAGNOLO, O. Development and validation of a mechanistic whole dairy farm model to evaluate farming strategies under grazing conditions in Uruguay. Conference Proceeding. In:18th World IMACS Congress and MODSIM International Congress on Modelling and Simulation: Interfacing Modelling and Simulation with Mathematical and Computational Sciences, Proceedings. Cairns, Australia 13-17 July 2009, p.512-518. 2-s2.0-80053020568 Sponsors: CSIRO, Australian Mathematical Sciences Institute, Griffith University,eWater Cooperative Research Centre, Department of Sustainability and Environment.| Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 94. | | ESPIGOLAN, R.; BALDI, F.; BANCHERO, G.; BRITO, G.; LA MANNA, A.; ALBUQUERQUE, L.G. Aplicação de modelos não-lineares para o ajuste de características. REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador, BA. Empreendedorismo e Progresso Científicos na Zootecnia
Brasileira de Vanguarda Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UEM, 2010. Anais| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 95. | | ESPIGOLAN, R.; BALDI, F.; BANCHERO, G.; BRITO, G.; LA MANNA, A.; ALBUQUERQUE, L.G. Efeito da estratégia de crescimento sobre as características de carcaça e da carne em novilhos da raça Hereford. REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador, BA. Empreendedorismo e Progresso Científicos na Zootecnia
Brasileira de Vanguarda Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UEM, 2010. Anais| Tipo: Abstracts/Resúmenes |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 96. | | ESPIGOLAN, R.; BALDI, F.; BOLIGON, A.A.; BANCHERO, G.; BRITO, G.; LA MANNA, A.; MONTOSSI, F.; FERNANDEZ, E.; ALBUQUERQUE, L.G. DE Aplicação de modelos não-lineares para descrever a evolução de características de crescimento e carcaça em bovinos da raça Hereford. [Application of nonlinear models to describe the evolution of growth and carcass traits in hereford cattle.] Ciência Rural, Santa Maria, v. 43, n. 3, p. 513-519, 2013. Article history: Recebido para publicação 16 agosto 2012 / Aprovado em 25 setembro 2012 / Devolvido pelo autor 21 novembro 2012 / CR-2012-0685.| Tipo: Artículos en Revistas Indexadas Internacionales | Circulación / Nivel : A - 2 |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Tacuarembó. |
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| 98. | | FERNANDEZ, E.; CLARIGET, J.M.; ZARZA, R.; LATTANZI, F.; BANCHERO, G.; LA MANNA, A.; CANOZZI, M.E.A. Sistemas ganaderos intensivos de la región suroeste y centro sur del país: ¿cuáles son las prácticas tecnológicas y decisiones de manejo predominantes en las empresas?. Primera parte: Caracterización de los sistemas, especies y manejo del pastoreo. Socio-Economía. Revista INIA Uruguay, 2020, no.63, p.34-38. (Revista INIA; 63).| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas. |
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| 99. | | FERNANDEZ, E.; CLARIGET, J.M.; ZARZA, R.; LATTANZI, F.; BANCHERO, G.; LA MANNA, A.; CANOZZI, M.E.A. Sistemas ganaderos intensivos de la región suroeste y centro sur del país: ¿cuáles son las prácticas tecnológicas y decisiones de manejo predominantes en las empresas?. Segunda parte: Reservas forrajeras, suplementación y cultivos de cobertura. Socio-Economía. Revista INIA Uruguay, 2021, no.64, p.55-60. (Revista INIA; 64).| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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